La Suisse, la France, l’Allemagne, le Luxembourg, les Pays-Bas et la Commission européenne, membres de la Commission Internationale pour la Protection du Rhin (CIPR), coopèrent avec l’Autriche, le Liechtenstein, la Région belge de Wallonie et l’Italie pour restaurer le Rhin et tous ses affluents.
Neuf Etats ou régions dans le bassin du Rhin coopèrent étroitement pour concilier les multiples intérêts en termes d’usage et de protection dans le bassin rhénan. Le développement durable du Rhin, de son milieu alluvial et l’atteinte du bon état dans toutes les eaux du bassin sont au centre de leurs activités.
Des Groupes de travail et d’experts, dotés d’un mandat défini, traitent toutes les questions techniques découlant de la mise en œuvre de la Convention pour la protection du Rhin et du droit communautaire. Une fois par an, des décisions sont prises dans le cadre de l’Assemblée plénière. La Conférence ministérielle sur le Rhin prend des décisions sur des questions politiques majeures et pose les jalons de futurs programmes de mesures cohérents et ajustés.
Dans les années 90 du siècle passé, les activités de la CIPR ont servi d’exemple à de nombreux autres bassins fluviaux.
La coopération dans l’espace rhénan a également influencé le processus d’élaboration de la directive cadre sur l’eau ainsi que de la directive communautaire sur les inondations.
Le 1er janvier 2023, la Présidence de la CIPR est passée de l'Union européenne à l'Allemagne. La nouvelle Présidente est Miriam Haritz. Elle succède à Veronica Manfredi de l'Union européenne et exercera ses fonctions jusque fin 2025. Miriam Haritz dirige la sous-direction de la gestion de l'eau et de la protection des eaux et du sol au sein du ministère fédéral allemand de l'environnement, de la protection de la nature, de la sécurité nucléaire et de la protection des consommateurs.